No tocante às pesquisas relacionadas às duas áreas de concentração do Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Produção e de Manufatura, dispõe-se de uma área de aproximadamente 4500 m2 ocupada por 13 laboratórios de pesquisa, a saber:

- Laboratório de Fabricação Digital (FABLAB);

- Laboratório de Informação e Apoio à Decisão (LASIAD);

- Laboratório Lean Simulation (LEANSIM);

- Laboratório de Estudos em Gestão de Operações Sustentáveis (LEGOS);

- Laboratório de Engenharia de Processos (LEP);

- Laboratório de Materiais (LMAT);

- Laboratório de Metalurgia (LMETAL);

- Laboratório de Simulação de Nanosistemas (LSNANO);

- Laboratório de Modelagem Industrial e Otimização (MIO);

- Observatório Regional de Logística (OBELOG);

- Laboratório de Simulação e Automação (SIMAUT);

- Laboratório de Simulação (SimuLab);

- Laboratório de Ciência e Tecnologia de Polímeros (LPol);

Os 13 laboratórios de pesquisa das engenharias se subdividem em 4 centros de pesquisa, a saber:

- Centro de Pesquisa Operacional (CPO);

- Centro de Pesquisa de Manufatura de Materiais Avançados (CPMMA);

- Centro de Pesquisas em Tecnologia da Mobilidade (CTMOBI);

- Centro de Pesquisa em Engenharia de Produção (CENPRO).