La Facultad de Ciencias Aplicadas es una unidad no departamental de docencia e investigación integrada por sus carreras de grado, posgrado, laboratorios y centros de investigación, organizaciones estudiantiles y las juntas de apoyo técnico y administrativo.
La alta dirección del Colegio está compuesta por la Congregación, la Junta Directiva, el Consejo Académico, el Consejo Administrativo y el Consejo de Organizaciones Estudiantiles. Es responsable de los procesos de gestión, toma de decisiones, ejecución de acciones y proyectos y seguimiento de los esfuerzos estratégicos de FCA.
Director
Prof. Dr. Márcio Alberto Torsoni
Vice-directora
Profa. Dra. Milena Pavan Serafim
Coordinador Técnico
Lucimara Andréia Trevizam
Secretária
Thaís Aparecida Polydoro de Souza Cirilo